考古学科现拥有考古学理论与实践、田野考古与测绘等四个教研室。2004年已经与中国社会科学院考古研究所共同组建“红山文化国际研究中心”、2009年与敖汉旗人民政府联合组建“中国兴隆洼文化研究所”，与巴林左旗人民政府联合组建“契丹辽文化研究中心”。目前又相继与内蒙古博物院、内蒙古文物考古研究所建立长期协作关系。
考古学专业已经逐渐成长为自治区高等院校系统的新兴学科。
培养目标：
培养适应现代化建设和未来社会发展需要，富有创新精神、实践能力和国际视野的高素质专门人才。具备考古学基本知识与技能的高层次人才，能够适应考古、文物、博物馆等事业单位及国家机关、科研教学、管理工作的高级专门人才。
课程设置：
主要课程：中国考古学、外国考古学、考古学史、考古学通论、田野考古学、考古学技术、古文字学、文化人类学和体质人类学、东北考古学、高句丽渤海考古等。