该专业具有植物保护一级学科硕士点、植物病理二级学科博士点以及2个省级重点实验室支撑，培养植物保护、植物检疫等领域具有综合运用、组织实施、优化决策及市场营销能力的高级科研与管理人才。该专业设三个专业方向：☆ 植物保护方向：以有害生物监测技术、综合治理技术、植物检疫、作物无公害生产等方面的课程为模块。毕业后能从事农业有害生物控制、森林保护、环境生物资源保护与利用等方面的教学、科研、技术开发与推广应用、科技成果转化等工作，以及从事入侵生物控制、出入境检验检疫、农产品安全生产等工作。
☆ 农药应用与管理方向：以农药化学品的研制开发、使用技术、质量检测及农药营销等方面的课程为模块。毕业后能从事农药化学品质量管理、产品开发、生产管理和市场营销等工作，也能从事农、林有害生物和城乡环境有害生物控制及农产品安全生产与检测等工作。