临床医学（八年制）：本博连读。培养基础扎实，人文素质好，能力强，发展后劲大，具有国际竞争力的高级临床医学专业人才。实施优生优培工程，全程配备优质导师，实行全程导学制度，全英文授课。
整体课程依据全球医学教育标准要求对医学生提出的七大学习领域要求设计。毕业时授予医学博士学位。本专业从2004年开始招生，是历年高分考生的首选专业之一。
该专业的课程学习分别在珠海校区（2年）和北校区（6年）完成。逐步构建和完善“243”型课程体系，即构建两重格局、四个主题、三个渗透的课程结构。两重格局是指：核心课程＋选修课程超市；四个主题是指：健康与疾病状态下的身体机能运作，医生与病人（病人家属），医学与社会（生物、心理、社会环境），专业与专业技能发展；三个渗透是指：健康的人格养成与科学的专业教育渗透，医学人文与科学方法渗透，基础与临床渗透。
主要专业课程：人体结构学、临床生理学、生物化学、医学病原学、免疫学、病理学、药理学、内科学、外科学、妇科、儿科、诊断学、医学心理学等。
临床医学专业（五年制）（国家特色专业、广东省名牌专业）：培养从事临床医疗工作的全科医师，或在高校、研究机构从事教学、科研工作的高级人才。毕业生就业率高，就业面广，培养的多数毕业生已成为各有关单位的教学、科研、管理部门的骨干，受到各用人单位的普遍好评。
开设的课程中大部分已经获评国家级或省级精品课程，具有雄厚的师资力量。
本专业学生利用业余科研、暑期科研、人文讲座、优秀文化讲座、科技文化周等活动，充实课余生活，拓展知识面。近2年来，通过完善“三早”（早期接触临床、早期接触科研、早期接触社会实践）医学教育新模式，参与学生科研培训的人数不断增多，学生在教师指导下撰写科研论文、综述共计766篇，其中有6篇文章获得第七届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛奖，17篇在国内正式学术刊物上发表。
实现了在学生早期学习阶段职业精神、创新意识、科学素养、临床思维、团队协作、群体保健与批判性思维能力的全面培养。
主要专业课程：人体结构学、临床生理学、生物化学、医学病原学、免疫学、病理学、药理学、内科学、外科学、妇科、儿科。
临床医学（眼科视光学方向，五年制）：中山大学眼科视光学系成立于1997年3月，是我国第一个也是目前唯一的一个在重点高等医学院校建立的眼科视光学本科教育机构，为国内视光学的发展、培养视光学专业人才、建立规范的视光学专业教育体制发挥着重要的作用。
我系的宗旨是培养从事现代眼科学和视光学的专业临床医师。学生通过系统的培养，不但能系统地掌握现代医学的基础理论、基本知识和医疗技能；还掌握眼科学、临床视光学、隐形眼镜学、眼镜学和低视力学的基础理论知识和临床应用；并着重掌握眼科疾病诊断和预防的实际技能，以及视光学功能检查和训练的操作技能；掌握一门外国语，具有阅读本专业外语书刊的能力。通过学习，使学生具有较强的自学能力和一定的分析解决问题的能力，了解本专业科学技术的进展，具有初步开展眼科学、视光学科学研究的能力。
学生修完教学计划规定的全部课程、考试合格、达到规定学分，准予毕业，可获医学学士学位。毕业后可参加执业医师及视光师考试，获得注册医师及视光师资格，从而获得手术权和处方权。
毕业后可在各级综合性医院、专科医院、医学院校、眼镜公司、眼科视光学器械研究部门从事眼科临床、视光学或管理工作，并可承担眼科视光学教学、科研等工作。
中山大学眼科视光学系在专业上依托中山眼科中心，利用其在眼科学、视光学教学、科研、临床及视光学相关产业商业经营的强大实力，为发展具有中国特色的眼科视光学教育提供了宝贵的资源和条件。中山眼科中心是目前世界上最具规模的二十间眼科中心之一，在建设规模、医疗设备、人才梯队、医疗服务、学术水平，以及门诊量、住院人数、手术例数等方面都处于全国领先地位。
在成立至今的12年中，中山大学眼科视光学系在教学、临床、科研工作方面都取得了长足的进步。
在本科教学方面，我们结合国际先进经验，以培养具有扎实医学基础的眼科视光学医师为目标，采用4年临床医学课程＋1年眼科视光学专业课程学习的精英教育模式，创办至今，共培养了十届200余名毕业生，历届毕业生的平均就业率达到98%, 并已有多位毕业生赴美攻读视光学博士学位。
我系拥有先进和齐全的眼科视光学教学、临床和科研设备，设备总价值超过1100万元，其中教学专用设备价值400万元。
在眼科视光学领域的科学研究上，勇于走在国际、国内的前沿，在国内率先成立了临床视光学、应用光学、隐形眼镜、眼镜工艺、低视力和双眼视觉等专项研究室，利用现有资源开展了一批视光学方面的科研项目。
2001年建立的广东省教育厅眼科视觉科学重点实验室，开展了视觉科学和视功能检测系列前沿的研究工作。至今已在国内外权威刊物上发表论文100多篇，其中SCI引用刊物10多篇；多次获得国家级、省部级科技成果奖，2007年至今，本系已获得了国家自然科学基金1项，省部级课题3项，厅局级课题2项，院系级课题1项，“211工程”重点学科建设基金1项及其他共20项的基金资助，资助总额达600多万元。
对外交流方面，先后与香港理工大学眼科视光学系、美国休斯顿大学视光学院和美国太平洋大学视光学院签订了长期的合作交流协议，并聘请香港理工大学医疗及社会科学院院长、美国休斯顿大学视光学院的教授为客座教授；聘请美国休斯敦大学视光学院院长为荣誉系主任及客座教授。
另外，作为中美二十一世纪视光学人才战略发展计划的中方发起单位之一，与美国新英格兰视光学院、美国休斯敦大学视光学院、美国加州大学伯克利分校视光学院等院校建立了良好的教学与科研协作关系。本系每年选派三名学生赴香港理工大学交换学习。
主要专业课程：人体结构学、医学病原学、内科学、外科学、诊断学、眼科应用光学、眼科学、临床视觉光学、角膜接触镜学、眼镜学（眼镜光学及验配学）。
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