（非师范）日语专业创建于1972年，是我国高校中最早设立的日语专业之一，1996年设立日语语言文学专业硕士点，1999年6月成立日语系，2006年6月成立我国第一所日语教学研究中心。日语系现有教师15名，其中教授4名，副教授3名，所有教师均有出国留学经验，整体学历层次高，师资力量雄厚，学术梯队合理，教学与科研水平在上海高校日语学科中名列前茅。另外，日语系常年聘请日籍专家2名。
近年来，本系出版专著7部，其中4部分别获得全国和省市级著作奖，1部列入海外博士论丛。其他成果有：编著、译著30多部，论文百余篇，创作作品10篇。集体科研项目有：教育部“十一五”修订教材《日本语听力教程》（第1~4册）、《基础日本语》（第1~4册）、教育部优秀教材《新编日汉翻译教程》、《新编汉日翻译教程》等。
本科教学主要以日本语言文学为主，学制4年。30多年来，日语系培养了千名以上高级日语人才，学生毕业后大多数在高校、外资企业、旅行社、广播电视台、报社、各级党政机关、银行等单位就职，其中不少成为知名学者、教育家和企业家。在最近几年的全国作文竞赛以及华东地区、上海市演讲比赛中，日语系学生多次荣获第一、第二名。
日语系每年举办一次演讲比赛与戏剧表演，每月定期举办系列讲座，并多次邀请国内外知名专家学者来校讲学，以提高学生的学习兴趣，拓宽知识面。同时，本系利用我校拥有200多名在校日本留学生的资源，组织中日学生交流学习。本系学生自主创办的系报《和风窗》，培养学生的语言运用实践能力，推动了系内师生间的交流。
本系还依托我校与日本近20所知名高校以及日本“国立国语研究所”的合作关系，积极开展学术交流，每年派遣留日学生10多名，重点培养日语高级人才，促进中日两国间的相互理解与友好往来。