武汉工程大学创建于1972年6月，原名湖北化工石油学院，隶属湖北省。1980年3月，经教育部批准，更名为武汉化工学院，改由原化工部主管。1998年7月，随着高校管理体制的调整，学校划转到湖北省管理，实行中央与地方共建，以湖北省管理为主。
同年，学校通过教育部本科教学合格评价，并获得硕士学位授予权。2006年2月，经教育部同意、湖北省人民政府批准，正式更名为武汉工程大学。 2006年以优秀的成绩通过教育部对我校本科教学工作水平的评估。
2008年学校被国务院学位委员会确定为新增博士学位授权立项建设单位。
经过38年的建设，学校已由单一的工科院校发展成为一所办学条件较好、实力较强、水平较高、特色鲜明的多科性教学型大学。
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