在七十至九十年代，在树仁学院获准开办香港政府认可之学士学位课程以前，基于香港政府的教育政策及法律所限，除法定大学以外，私立院校开办的学士学位课程并没有得到政府之认可，当中包括中华民国（台湾）政府承认并由当地教育部颁发学位的珠海书院课程。当时树仁学院如同其他私立大专院校（包括升格为大学前的浸会学院及岭南学院）一样，开办香港政府认可的全日制及兼读制荣誉文凭课程。在政府意图统一专上教育为三年制的教育政策下，树仁学院没有如其他学院一样接受政府资助及改行三年制课程，并继续以私立大专院校的身份坚持开办四年制荣誉文凭课程。
　　树仁学院一直以大学本科的规格举办荣誉文凭课程，她的荣誉文凭亦因此而广受外界认可，例如中国大陆教育部便认可树仁学院的荣誉文凭等同学士学位，外国亦有不少大学同样认可树仁学院的荣誉文凭等同学士学位，另外，树仁学院的法律及商业学荣誉文凭的毕业生更可以透过英国的Common Professional Examination考取律师资格。
　　在香港学术评审局对树仁学院之课程进行评审以前，树仁学院已停办所有兼读制荣誉文凭课程。在树仁学院接受首次评审后，该局认为树仁学院“拥有举办学位课程的能力”。树仁学院首批学士学位课程在2001年起开办。现时，树仁大学的所有荣誉文凭课程都经已通过香港学术评审局评审而成为学士学位课程。树仁之荣誉文凭毕业生已可透过修读由校方主办的衔接课程以取得荣誉学士学位。
　　除树仁大学的课程外，树仁大学亦有与中国、美国、英国和澳洲的大学合办课程，这些合办课程分为“分段课程”和“校外课程”。
分段课程 - 部份学科或学期在树仁大学上课，并由树仁大学的教职员任教，其余学科或学期则在主办大学上课，并由主办大学的教职员任教。
校外课程 - 全期课程于树仁大学上课，由主办大学派遣教职员到树仁大学教授。